總體上來說凝膠成像可應用在：

凝膠成像系統可以用在：蛋白質、 多肽、氨基酸、核酸、多聚氨基酸等其他生物分子的分離純化結果作定性分析

 （1）分子量定量 對于般常用的DNA膠片,利用分子量定量功能,通過對膠上DNA Marker條帶的已知分子量注釋,自動生成擬合曲線,并以它衡量得到未知條帶的分子量。通過這種方案所得到的結果較肉眼觀察估計要準確很多。

 （2）密度定量 般常用的測量DNA和RNA濃度的方案是紫外吸收法,但它只能測量樣品中的總核苷酸濃度,而不能區分各個長度片段的濃度。利用凝膠成像系統和軟件,先將DNA膠片上某已知其DNA含量的標準條帶進行密度標定以后,可以方便的單擊其他未知條帶，根據與已知條帶的密度做比較，可以得到未知DNA的含量。此方案也適用在對PA GE蛋白膠條帶的濃度測量。